পরমাণুর গাঠনিক মডেল বিজ্ঞানের একটি মৌলিক ধারণা, যা BCS পরীক্ষায় গুরুত্বপূর্ণ। রাদারফোর্ডের পরমাণু মডেল অনুযায়ী, পরমাণুর কেন্দ্রে ধনাত্মক চার্জযুক্ত নিউক্লিয়াস এবং এর চারদিকে ইলেকট্রন ঘুরছে। পরে বোর এই মডেলকে সংশোধন করে ইলেকট্রনের কক্ষপথের ধারণা যোগ করেন, যেখানে ইলেকট্রন নির্দিষ্ট শক্তিস্তরে অবস্থান করে।
ইলেকট্রন বিন্যাস পরমাণুর রাসায়নিক ধর্ম নির্ধারণ করে। Aufbaus নীতি, Hund’s নীতি এবং Pauli’s বর্জন নীতি অনুসারে ইলেকট্রনগুলি কক্ষপথে বিন্যস্ত হয়। উদাহরণস্বরূপ, সোডিয়াম (Na) এর ইলেকট্রন বিন্যাস হল 1s² 2s² 2p⁶ 3s¹, যা এর রাসায়নিক ক্রিয়াকলাপ ব্যাখ্যা করে।